AT4G35580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.576 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC transcription factor-like 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAC transcription factor-like 9 (NTL9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAC 014 (TAIR:AT1G33060.1); Has 3027 Blast hits to 3020 proteins in 75 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 3027; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16888581..16890744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57252.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGAVSMESLP LGFRFRPTDE ELVNHYLRLK INGRHSDVRV IPDIDVCKWE PWDLPALSVI KTDDPEWFFF CPRDRKYPNG HRSNRATDSG YWKATGKDRS 101: IKSKKTLIGM KKTLVFYRGR APKGERTNWI MHEYRPTLKD LDGTSPGQSP YVLCRLFHKP DDRVNGVKSD EAAFTASNKY SPDDTSSDLV QETPSSDAAV 201: EKPSDYSGGC GYAHSNSTAD GTMIEAPEEN LWLSCDLEDQ KAPLPCMDSI YAGDFSYDEI GFQFQDGTSE PDVSLTELLE EVFNNPDDFS CEESISRENP 301: AVSPNGIFSS AKMLQSAAPE DAFFNDFMAF TDTDAEMAQL QYGSEGGASG WPSDTNSYYS DLVQQEQMIN HNTENNLTEG RGIKIRARQP QNRQSTGLIN 401: QGIAPRRIRL QLQSNSEVKE REEVNEGHTV IPEAKEAAAK YSEKSGSLVK PQIKLRARGT IGQVKGERFA DDEVQVQSRK RRGGKRWKVV ATVMVAVMVG 501: VGMGIWRTLV SS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)