AT2G44080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.885 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (endoplasmic reticulum marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARGOS-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes ARL, a gene similar to ARGOS involved in cell expansion-dependent organ growth. Upregulated by brassinosteroid. Acts downstream of BRI1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARGOS-like (ARL); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: auxin-regulated gene involved in organ size (TAIR:AT3G59900.1); Has 88 Blast hits to 88 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 88; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18237726..18238133 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15000.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 135 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIREFSSLQN DIINIQEHYS LNNNMDVRGD HNRKNTSFRG SAPAPIMGKQ ELFRTLSSQN SPRRLISASY FSLESMVVLV GLTASLLILP LILPPLPPPP 101: FMLLLIPIGI MVLLMVLAFM PSSNSKHVSS SSTFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)