AT4G26455.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.936 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WPP domain interacting protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
WPP domain interacting protein 1 (WIP1); FUNCTIONS IN: protein homodimerization activity, protein heterodimerization activity; LOCATED IN: nuclear envelope, cell plate; EXPRESSED IN: root; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WPP domain interacting protein 2 (TAIR:AT5G56210.1); Has 450 Blast hits to 403 proteins in 126 species: Archae - 15; Bacteria - 85; Metazoa - 55; Fungi - 14; Plants - 89; Viruses - 10; Other Eukaryotes - 182 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13365737..13367384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53904.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 489 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLESESSAL ESVDDNVLIQ QSASNVCDDG RSLDNGSCSD ESVKLLSTSN SVELGKPMSF DSPGDGGGAY SPVLKGQGLR KWRRIRRDLV KDTSANMENS 101: KALKRGLSGV AHSHGKQMQF QSPEVEQESQ GSVGSVNMLK SSGDGFDILG SSGYDSRFVA GVGFSAGMDL EIDDDRSSKS STVARAPKVI RYEKPMISSG 201: QGGNIRVENS KKHRGESVDF EKENSYSSLE SDSRKQSGRM MDYNGENGET SMRKDDAGGE GGESINTDNR YSDEMDPLTE AINGFLALQD ALEKEVQQFQ 301: EIGNEPMPQH HEQVSEANSP HPEIVTLVNN VEQLENMLEE TRSMLEVKES HIRDLESTTN QSKHSWGGTE IVVEDIFRQK IEAEIEYLIY SRSIDNLNSQ 401: MKLIDEQESL AEEQTHETLN KLGRVQTKAA NFTNRAQDLQ NDCIEITGTI KKRACKITSY VLIQLVLLST VVLLLLSQLL PEPDTVVPT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)