AT3G63480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP binding microtubule motor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATP binding microtubule motor family protein; FUNCTIONS IN: microtubule motor activity, ATP binding; INVOLVED IN: microtubule-based movement; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phragmoplast-associated kinesin-related protein 1 (TAIR:AT4G14150.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:23441065..23443809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51828.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 469 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNVTVCARF RPRSSKEMRD PSRDGVCARP IDAETFVFQD DKEDEFTFSL DRVFYEDSTQ AAVYEFLALP IMRDAVNGIN GTIITYGQTG AGKTYSMEGP 101: GIQDCDEHNK GLLPRVVHGM FEQISSSNDI ARYTVKLSMV EIYMEKVRDL LDLSKANIQI KENKTQGILL SGVTEASFIV PVSDSVEALQ HLCTGLANRA 201: VGETQMNMSS SRSHCAYLFT IQQDSVKDKR VKTGKLILVD LAGSEKADKT GAEGRVLEEA KTINKSLSAL GNVINALTSG PSSKGNHIPY RDSKLTRILQ 301: DALGGNSRMA LLCCCSPSTL NASETLSTLR FGMRAKHIKA SPRASEVKSA KAQEEPSSVT KDEKCGRILE KMKERMSNED IKMLEDVFIQ EGIIFSLDSM 401: AEVETVYEDI VSKTIQSLQQ AVDELQQKVK KLEAENIGIQ EQALRNHEPG SVGKMSRFIS SWYASFFTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)