AT1G13560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.794 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aminoalcoholphosphotransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes aminoalcoholphosphotransferase AAPT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aminoalcoholphosphotransferase 1 (AAPT1); FUNCTIONS IN: phosphatidyltransferase activity, phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups; INVOLVED IN: phospholipid biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Choline/ethanolaminephosphotransferase (InterPro:IPR014472), CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aminoalcoholphosphotransferase (TAIR:AT3G25585.4); Has 927 Blast hits to 921 proteins in 239 species: Archae - 6; Bacteria - 34; Metazoa - 364; Fungi - 227; Plants - 82; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 214 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4638834..4641691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43544.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGYIGAHGVA ALHRYKYSGV DHSYLAKYVL QPFWTRFVKV FPLWMPPNMI TLMGFMFLVT SSLLGYIYSP QLDSPPPRWV HFAHGLLLFL YQTFDAVDGK 101: QARRTNSSSP LGELFDHGCD ALACAFEAMA FGSTAMCGRD TFWFWVISAI PFYGATWEHY FTNTLILPVI NGPTEGLALI FVSHFFTAIV GAEWWAQQLG 201: QSIPLFSWVP FVNEIQTSRA VLYMMIAFAV IPTVAFNVTN VYKVVRSRNG SMVLALAMLY PFVVLLGGVL IWDYLSPINL IATYPHLVVL GTGLAFGFLV 301: GRMILAHLCD EPKGLKTNMC MSLLYLPFAL ANALTARLNA GVPLVDELWV LLGYCIFTVS LYLHFATSVI HEITEALGIY CFRITRKEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)