AT1G10030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.553 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of yeast ergosterol28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
homolog of yeast ergosterol28 (ERG28); INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Erg28-like (InterPro:IPR005352); Has 223 Blast hits to 223 proteins in 105 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 67; Fungi - 94; Plants - 48; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3273972..3275631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14805.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 129 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKALGYWLMV VGSLRLASVW FGFFNIWALR LAVFSQTTMS EVHGRTFGVW TLLTCTLCFL CAFNLENKPL YLATFLSFIY ALGHFLTEYL FYQTMTIANL 101: STVGFFAGTS IVWMLLEWNS LEQPHSKLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)