AT1G31812.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acyl-CoA-binding protein 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Acyl-CoA-binding protein. Bind acyl-CoA esters and protect acyl-CoAs from degradation by microsomal acyl-hydrolases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acyl-CoA-binding protein 6 (ACBP6); FUNCTIONS IN: phosphatidylcholine binding, acyl-CoA binding; INVOLVED IN: response to freezing, response to cold, lipid transport; LOCATED IN: cytosol, plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl-CoA-binding protein, ACBP (InterPro:IPR000582), FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle (InterPro:IPR014352); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acyl-CoA binding protein 1 (TAIR:AT5G53470.1); Has 1828 Blast hits to 1828 proteins in 405 species: Archae - 0; Bacteria - 293; Metazoa - 888; Fungi - 180; Plants - 233; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 234 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11411132..11412099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10386.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 92 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MGLKEEFEEH AEKVNTLTEL PSNEDLLILY GLYKQAKFGP VDTSRPGMFS MKERAKWDAW KAVEGKSSEE AMNDYITKVK QLLEVAASKA ST | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)