AT2G27960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin-dependent kinase-subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
catalytic subunit of cyclin dependent kinase 1. physically interact with cyclin-dependent kinases (CDKs) and play an essential, but yet not entirely resolved, role in the regulation of the cell cycle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cyclin-dependent kinase-subunit 1 (CKS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin-dependent kinase, regulatory subunit (InterPro:IPR000789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CDK-subunit 2 (TAIR:AT2G27970.1); Has 657 Blast hits to 657 proteins in 207 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 305; Fungi - 139; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 108 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11910903..11911543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10521.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 87 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MGQIQYSEKY FDDTFEYRHV VLPPEVAKLL PKNRLLSENE WRAIGVQQSR GWVHYAVHRP EPHIMLFRRP LNYQQQQENQ AQNMLVK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)