AT3G11270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mov34/MPN/PAD-1 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
maternal effect embryo arrest 34 (MEE34); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mov34/MPN/PAD-1 (InterPro:IPR000555); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RP non-ATPase subunit 8A (TAIR:AT5G05780.1); Has 1383 Blast hits to 1379 proteins in 243 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 560; Fungi - 337; Plants - 281; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 205 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3528989..3531317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35087.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 310 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVIKTQQIS ARTIEKVIVH PLVLLSIVDH YNRVAKDTSK RVVGVLLGSS SRGTVDVTNS YAVPFEEDDK DTSIWFLDHN YHESMFHMFK RINAKEHIVG 101: WYSTGPKLRE NDLDVHALFN GYVPNPVLVI IDVQPKELGI PTKAYYAVEE VKENATQKSQ QVFVHVPTEI AAHEVEEIGV EHLLRDVKDT TISTLATEVT 201: AKLTALKGLD ARLREIRTYL DLVIEGKLPL NHEILYHLQD VFNLLPNLNV NELVKAFAVK TNDMMLVIYL SSLIRSVIAL HSLINNKLLN KEHEKAEDSK 301: PVDIPLITES |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)