AT2G27970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CDK-subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CDK-subunit 2 (CKS2); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity, cyclin-dependent protein kinase activity; INVOLVED IN: cell cycle; LOCATED IN: nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin-dependent kinase, regulatory subunit (InterPro:IPR000789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin-dependent kinase-subunit 1 (TAIR:AT2G27960.1); Has 657 Blast hits to 657 proteins in 207 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 305; Fungi - 139; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 108 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11912460..11913112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 9987.96 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 83 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MGQIQYSDKY FDDTFEYRHV VLPPEVAKLL PKNRILSESE WRAIGVQQSR GWVHYAIHRP EPHIMLFRRP LNYQQEHQAQ IAK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)