AT3G57650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lysophosphatidyl acyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an endoplasmic reticulum localized protein with lysophosphatidyl acyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lysophosphatidyl acyltransferase 2 (LPAT2); FUNCTIONS IN: 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lysophosphatidyl acyltransferase 3 (TAIR:AT1G51260.1); Has 1646 Blast hits to 1643 proteins in 516 species: Archae - 0; Bacteria - 639; Metazoa - 536; Fungi - 213; Plants - 138; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21349751..21352839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43678.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVIAAAVIVP LGLLFFISGL AVNLFQAVCY VLIRPLSKNT YRKINRVVAE TLWLELVWIV DWWAGVKIQV FADNETFNRM GKEHALVVCN HRSDIDWLVG 101: WILAQRSGCL GSALAVMKKS SKFLPVIGWS MWFSEYLFLE RNWAKDESTL KSGLQRLSDF PRPFWLALFV EGTRFTEAKL KAAQEYAASS ELPIPRNVLI 201: PRTKGFVSAV SNMRSFVPAI YDMTVTIPKT SPPPTMLRLF KGQPSVVHVH IKCHSMKDLP ESDDAIAQWC RDQFVAKDAL LDKHIAADTF PGQQEQNIGR 301: PIKSLAVVLS WACVLTLGAI KFLHWAQLFS SWKGITISAL GLGIITLCMQ ILIRSSQSER STPAKVVPAK PKDNHHPESS SQTETEKEK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)