AT1G11680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CYTOCHROME P450 51G1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative obtusifoliol 14-alpha demethylase involved in sterol biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CYTOCHROME P450 51G1 (CYP51G1); FUNCTIONS IN: sterol 14-demethylase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: sterol biosynthetic process, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group IV (InterPro:IPR002403), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 707, subfamily A, polypeptide 4 (TAIR:AT3G19270.1); Has 30265 Blast hits to 30215 proteins in 1662 species: Archae - 71; Bacteria - 5605; Metazoa - 9913; Fungi - 5125; Plants - 8048; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1497 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3938925..3940585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55498.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 488 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELDSENKLL KTGLVIVATL VIAKLIFSFF TSDSKKKRLP PTLKAWPPLV GSLIKFLKGP IIMLREEYPK LGSVFTVNLV HKKITFLIGP EVSAHFFKAS 101: ESDLSQQEVY QFNVPTFGPG VVFDVDYSVR QEQFRFFTEA LRVNKLKGYV DMMVTEAEDY FSKWGESGEV DIKVELERLI ILTASRCLLG REVRDQLFDD 201: VSALFHDLDN GMLPISVLFP YLPIPAHRRR DRAREKLSEI FAKIIGSRKR SGKTENDMLQ CFIESKYKDG RQTTESEVTG LLIAALFAGQ HTSSITSTWT 301: GAYLMRYKEY FSAALDEQKN LIAKHGDKID HDILSEMDVL YRCIKEALRL HPPLIMLMRA SHSDFSVTAR DGKTYDIPKG HIVATSPAFA NRLPHIFKDP 401: DTYDPERFSP GREEDKAAGA FSYIAFGGGR HGCLGEPFAY LQIKAIWSHL LRNFELELVS PFPEIDWNAM VVGVKGNVMV RYKRRQLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)