AT5G16390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chloroplastic acetylcoenzyme A carboxylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes for the biotin carboxyl-carrier subunit of the multi-enzyme plastidial acetyl-coenzyme A carboxylase complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chloroplastic acetylcoenzyme A carboxylase 1 (CAC1); FUNCTIONS IN: acetyl-CoA carboxylase activity, biotin binding; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Biotin-binding site (InterPro:IPR001882), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier (InterPro:IPR001249), Biotin/lipoyl attachment (InterPro:IPR000089); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: biotin carboxyl carrier protein 2 (TAIR:AT5G15530.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5361098..5363020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29614.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 280 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSSFSVTS PAAAASVYAV TQTSSHFPIQ NRSRRVSFRL SAKPKLRFLS KPSRSSYPVV KAQSNKVSTG ASSNAAKVDG PSSAEGKEKN SLKESSASSP 101: ELATEESISE FLTQVTTLVK LVDSRDIVEL QLKQLDCELV IRKKEALPQP QAPASYVMMQ QPNQPSYAQQ MAPPAAPAAA APAPSTPASL PPPSPPTPAK 201: SSLPTVKSPM AGTFYRSPAP GEPPFIKVGD KVQKGQVLCI VEAMKLMNEI ESDHTGTVVD IVAEDGKPVS LDTPLFVVQP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)