AT1G19450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Major facilitator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Major facilitator superfamily protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT1G75220.1); Has 32354 Blast hits to 31683 proteins in 2302 species: Archae - 652; Bacteria - 16202; Metazoa - 5205; Fungi - 6407; Plants - 2489; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1397 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6731671..6734633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52790.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 488 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFRDDNTEE GRNDLRRPFL HTGSWYRMGS RQSSMLESSQ VIRDSSISVL ACVLIVALGP IQFGFTCGYS SPTQAAITKD LGLTVSEYSV FGSLSNVGAM 101: VGAIASGQIA EYVGRKGSLM IAAIPNIIGW LSISFAKDTS FLYMGRLLEG FGVGIISYTV PVYIAEIAPQ TMRGALGSVN QLSVTIGIML AYLLGLFVPW 201: RILAVLGVLP CTLLIPGLFF IPESPRWLAK MGLTDDFETS LQVLRGFETD ITVEVNEIKR SVASSSKRSA VRFVDLKRRR YYFPLMVGIG LLALQQLGGI 301: NGVLFYSSTI FESAGVTSSN VATFGVGVVQ VVATGIATWL VDKAGRRLLL MISSIGMTIS LVIVAVAFYL KEFVSPDSNM YNILSMVSVV GVVAMVISCS 401: LGMGPIPWLI MSEILPVNIK GLAGSIATLL NWFVSWLVTM TANMLLAWSS GGTFTLYALV CGFTVVFVSL WVPETKGKTL EEIQALFR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)