AT2G01770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar iron transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an iron transporter required for iron sequestration into vacuoles. Expressed in developing embryo and seed. Localized in the vacuolar membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar iron transporter 1 (VIT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF125, transmembrane (InterPro:IPR008217); Has 1947 Blast hits to 1945 proteins in 688 species: Archae - 106; Bacteria - 1196; Metazoa - 0; Fungi - 163; Plants - 191; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 291 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:334775..336425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26861.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSEEDKITR ISIEPEKQTL LDHHTEKHFT AGEIVRDIII GVSDGLTVPF ALAAGLSGAN ASSSIVLTAG IAEVAAGAIS MGLGGYLAAK SEEDHYAREM 101: KREQEEIVAV PETEAAEVAE ILAQYGIEPH EYSPVVNALR KNPQAWLDFM MRFELGLEKP DPKRALQSAF TIAIAYVLGG FIPLLPYMLI PHAMDAVVAS 201: VVITLFALFI FGYAKGHFTG SKPLRSAFET AFIGAIASAA AFCLAKVVQH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)