AT4G23710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.500 vacuole 0.500 ASURE: golgi,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar ATP synthase subunit G2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar ATP synthase subunit G2 (VAG2); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances; INVOLVED IN: proton transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Vacuolar (H+)-ATPase G subunit (InterPro:IPR005124); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vacuolar membrane ATPase 10 (TAIR:AT3G01390.2); Has 639 Blast hits to 639 proteins in 196 species: Archae - 2; Bacteria - 5; Metazoa - 338; Fungi - 118; Plants - 124; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12350577..12351354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11742.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 106 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESAGIQQLL AAEREAQQIV NAARTAKMTR LKQAKEEAET EVAEHKTSTE QGFQRKLEAT SGDSGANVKR LEQETDAKIE QLKNEATRIS KDVVDMLLKN 101: VTTVNN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)