AT4G02620.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar ATPase subunit F family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
vacuolar ATPase subunit F family protein; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism, proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, V1 complex, subunit F, eukaryotic (InterPro:IPR005772), ATPase, V1/A1 complex, subunit F (InterPro:IPR008218); Has 520 Blast hits to 520 proteins in 240 species: Archae - 39; Bacteria - 0; Metazoa - 211; Fungi - 130; Plants - 61; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 79 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr4:-:1149419..1151132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 14260.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 128 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGRATIPAR NSALIAMIAD EDTVVGFLMA GVGNVDIRRK TNYLIVDSKT TVRQIEDAFK EFSARDDIAI ILLSQYIANM IRFLVDSYNK PVPAILEIPS 101: KDHPYDPAHD SVLSRVKYLF SAESVSQR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)