AT4G24520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P450 reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cyp450 reductase likely to be involved in phenylpropanoid metabolism. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
P450 reductase 1 (ATR1); FUNCTIONS IN: NADPH-hemoprotein reductase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, phenylpropanoid metabolic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254), Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding (InterPro:IPR001433), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938), FAD-binding, type 1 (InterPro:IPR003097), Flavoprotein pyridine nucleotide cytochrome reductase (InterPro:IPR001709), NADPH Cytochrome P450 Reductase (InterPro:IPR015702); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P450 reductase 2 (TAIR:AT4G30210.2); Has 6349 Blast hits to 5969 proteins in 1541 species: Archae - 6; Bacteria - 2994; Metazoa - 1048; Fungi - 898; Plants - 566; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 837 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12663065..12667066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76769.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 692 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSALYASDL FKQLKSIMGT DSLSDDVVLV IATTSLALVA GFVVLLWKKT TADRSGELKP LMIPKSLMAK DEDDDLDLGS GKTRVSIFFG TQTGTAEGFA 101: KALSEEIKAR YEKAAVKVID LDDYAADDDQ YEEKLKKETL AFFCVATYGD GEPTDNAARF YKWFTEENER DIKLQQLAYG VFALGNRQYE HFNKIGIVLD 201: EELCKKGAKR LIEVGLGDDD QSIEDDFNAW KESLWSELDK LLKDEDDKSV ATPYTAVIPE YRVVTHDPRF TTQKSMESNV ANGNTTIDIH HPCRVDVAVQ 301: KELHTHESDR SCIHLEFDIS RTGITYETGD HVGVYAENHV EIVEEAGKLL GHSLDLVFSI HADKEDGSPL ESAVPPPFPG PCTLGTGLAR YADLLNPPRK 401: SALVALAAYA TEPSEAEKLK HLTSPDGKDE YSQWIVASQR SLLEVMAAFP SAKPPLGVFF AAIAPRLQPR YYSISSSPRL APSRVHVTSA LVYGPTPTGR 501: IHKGVCSTWM KNAVPAEKSH ECSGAPIFIR ASNFKLPSNP STPIVMVGPG TGLAPFRGFL QERMALKEDG EELGSSLLFF GCRNRQMDFI YEDELNNFVD 601: QGVISELIMA FSREGAQKEY VQHKMMEKAA QVWDLIKEEG YLYVCGDAKG MARDVHRTLH TIVQEQEGVS SSEAEAIVKK LQTEGRYLRD VW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)