AT3G58490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein; FUNCTIONS IN: sphingosine-1-phosphate phosphatase activity, phosphoric ester hydrolase activity; INVOLVED IN: response to abscisic acid stimulus; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase (InterPro:IPR000326); Has 1219 Blast hits to 1219 proteins in 452 species: Archae - 20; Bacteria - 742; Metazoa - 137; Fungi - 144; Plants - 35; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 141 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21633065..21635057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46171.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 416 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKILERSME GSGTWQGLVL VGIVTWICAS SYLKFTHKFR SLLQPWVARQ VVGGVPLILR IQKCQNGVLD AFFSGLSCVV SVPFYTAFLP LLFWSGHGRL 101: ARQMTLLIAF CDYLGNCIKD VVSAPRPSCP PVRRITATKD EEDNAMEYGL PSSHTLNTVC LSGYLLHYVL SSLEYESVSI QYYGFALACL LVALIAFGRV 201: YLGMHSVVDI VSGLAIGVLI LGLWLTVNEK LDDFITSKQN VSSFWTALSF LLLFAYPTPE HPTPSYEYHT AFNGVTLGIV TGVQQTYSQF HHEAAPRIFS 301: PELPISSYLG RVMVGIPTIL LVKFCSKSLA KWTLPMVSNA LGIPIRSSMY IPKLKGYASG KKTDEPKNSV GYLQKLCEFL SHDSFDIDTG IRFFQYAGLA 401: WSVVDLVPSL FSYVNL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)