AT2G46260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BTB/POZ/Kelch-associated protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BTB/POZ/Kelch-associated protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BTB/POZ (InterPro:IPR013069), BTB/Kelch-associated (InterPro:IPR011705), BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333), Kelch related (InterPro:IPR013089), BTB/POZ-like (InterPro:IPR000210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: POZ/BTB containin G-protein 1 (TAIR:AT3G61600.1); Has 3374 Blast hits to 3358 proteins in 97 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3133; Fungi - 0; Plants - 140; Viruses - 10; Other Eukaryotes - 91 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18996111..18998463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63040.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 561 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGSNNTDLF DPKTEMDSNF SRHGSSSEGD FGFAFNDSNF SDRLLRIEIL GGPSDSRSDA EGCTSIADWA RHRKRRREDN KKDNGVAISD IVACAEEQIL 101: TDNNQPDMDD APGGDNLDDE GEAMVEEALS GDDDASSEPN WGIDCSTVVR VKELHISSPI LAAKSPFFYK LFSNGMRESE QRHVTLRISA QEEGALMELL 201: NFMYSNSLSV TTAPALLDVL MAADKFEVAS CMRYCSRLLR NMPMTPDSAL LYLELPSSVL MAEAVQPLTD AAKQFLASRY KDITKFHDEV MALPLAGIEA 301: ILSSDDLQIA SEDAVYDFVL KWARGQYSSL EDRREILGSR LALYIRFPYM TCRKLKKVLT CSDFEHEVAS KQVLEALFFK AEAPHRQRIL AAEGSDSMNR 401: RFIERAYKYR PVKVVEFELP RPQCVVYLDL KREECAGLFP SGRVYSQAFH LGGQGFFLSA HCNMDQQSSF HCFGLFLGMQ EKGAVSFGVD YEFAARDKST 501: KEEYVSKYKG NYTFTGGKAV GYRNLFGIPW TSFIAEDSQH FINGILHLRA ELTIKRSSDL H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)