AT3G61600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : POZ/BTB containin G-protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
POZ/BTB containing-protein AtPOB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
POZ/BTB containin G-protein 1 (POB1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BTB/POZ (InterPro:IPR013069), BTB/Kelch-associated (InterPro:IPR011705), BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333), Kelch related (InterPro:IPR013089), BTB/POZ-like (InterPro:IPR000210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BTB/POZ/Kelch-associated protein (TAIR:AT2G46260.1); Has 3471 Blast hits to 3456 proteins in 95 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3227; Fungi - 0; Plants - 131; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22795704..22797953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63068.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 561 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGTTENTDL FDPKTQMDPD FTRHGSSSDG DFGFAFNDSN FSDRLLRIEI MGGPSDSRSE VEGCTSIADW ARHRKRRRED IKKESGVTIS DIVACPEEQI 101: LTDEQPDMDG CPGGENPDDE GGEAMVEEAL SGDEEETSSE PNWGMDCSTV VRVKELHISS PILAAKSPFF YKLFSNGMRE SEQRHVTLRI NASEEAALME 201: LLNFMYSNAV SVTTAPALLD VLMAADKFEV ASCMRYCSRL LRNMPMTPES ALLYLELPSS VLMAKAVQPL TDAAKQFLAA RYKDITKFHE EVMSLPLAGI 301: EAILSSDELQ IASEDAVYDF ILKWARAQYP CLEERREILG SRLALSIRFP FMTCRKLKKV LTCSDFEHEI ASKLVLEALF FKAEAPHRQR SLASEESASL 401: NRRLIERAYK YRPVKVVEFE LPRPQCVVYL DLKREECGGL FPSGRVYSQA FHLGGQGFFL SAHCNMDQQS SFHCFGLFLG MQEKGSVSFG VDYEFSARSK 501: PAEDFISKYK GNYTFTGGKA VGYRNLFGVP WTSFIAEDSQ YFINGILHLR AELTIKRSTD P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)