AT2G42400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vascular plant one zinc finger protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
vascular plant one zinc finger protein 2 (VOZ2); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vascular plant one zinc finger protein (TAIR:AT1G28520.2); Has 87 Blast hits to 82 proteins in 14 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 83; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17654490..17656281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50568.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 450 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNHPKITSA HQNVEEKLRE LQERFCHLQA ARKEGRHGDL ALLEAQISQN IREWQAELTA PSPESSLLGE GISQFLEEFA PLLKLDEEDD ATSTLKEHAG 101: AKPDPEGFSQ SLCPPEWTSE NFSQSPFNGN FSCGFEDALN STETHGQQLH YGYEGFDPSI NSAPDFHDQK LSSNLDITSQ YDYIFSEVRQ ELDNSPSTKL 201: DSSEEIDNFA EFSTPSSVRV PPSAFLGPKC ALWDCTRPAQ GSEWYLDYCS NYHGTLALNE DSPGTAPVLR PGGISLKDNL LIDALRAKTQ GKNVGIPVCE 301: GAVNTKCPWN AAELFHLELV EGETIREWLF FDKPRRAYDS GNRKQRSLPD YSGRGWHESR KQLMKEQEGQ KRSYYMDPQP PGPFEWHLFE YQINESDACA 401: LYRLELKVGN GKKSPKGKIS KDPLADLQKK MGQFKVASDK PSPPTKGRKE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)