AT1G08970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nuclear factor Y, subunit C9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
heme activated protein (HAP5c) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nuclear factor Y, subunit C9 (NF-YC9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone (InterPro:IPR003958), Histone-fold (InterPro:IPR009072); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nuclear factor Y, subunit C3 (TAIR:AT1G54830.3); Has 1343 Blast hits to 1343 proteins in 228 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 451; Fungi - 349; Plants - 427; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 116 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2883144..2883839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25641.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 231 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQQDHGQSG AMNYGTNPYQ TNPMSTTAAT VAGGAAQPGQ LAFHQIHQQQ QQQQLAQQLQ AFWENQFKEI EKTTDFKNHS LPLARIKKIM KADEDVRMIS 101: AEAPVVFARA CEMFILELTL RSWNHTEENK RRTLQKNDIA AAVTRTDIFD FLVDIVPRED LRDEVLGSIP RGTVPEAAAA GYPYGYLPAG TAPIGNPGMV 201: MGNPGGAYPP NPYMGQPMWQ QQAPDQPDQE N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)