AT5G15500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G10720.1); Has 5035 Blast hits to 3438 proteins in 197 species: Archae - 6; Bacteria - 200; Metazoa - 919; Fungi - 164; Plants - 868; Viruses - 22; Other Eukaryotes - 2856 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5031791..5032846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39695.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 351 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTPLLVAVSR KKIDLMSEFF LGCPESIVDA NVNGENALHI AVNNYDQREG LSVLKVLMGW ILRLCQKDAE WIETRVINRR DKDGNTPLHL AAYEINRQAM 101: KLLLESSKIN VNIENKNGLT VFDIAVLHNN REIERMVKRH GGKRSVSLVK IKTTSDILAS QLSWRESRRT KKIRFYSWIS EERRNALLVV ATLIVTATYQ 201: TVLQPPGGVS DGGGQKSGTS GPKAGSVVMD EVYFIWLWLW NSAGFCFAIE MMIRLLSLGQ ESMFWYYPLF VPMVLAYSVA GDVIKPNARA YTIAGVGAIV 301: VLIIWGLVVW FWEWVQSKRT KQRGPKSGLV WEGFTTLDQA RGVAPNRYVI R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)