AT1G56600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactinol synthase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galactinol synthase 2 (GolS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactinol synthase 3 (TAIR:AT1G09350.1); Has 1296 Blast hits to 1295 proteins in 304 species: Archae - 0; Bacteria - 134; Metazoa - 258; Fungi - 290; Plants - 471; Viruses - 73; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:21207620..21209291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38517.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 335 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPEINTKLT VPVHSATGGE KRAYVTFLAG TGDYVKGVVG LAKGLRKAKS KYPLVVAVLP DVPEDHRKQL VDQGCVVKEI EPVYPPENQT EFAMAYYVIN 101: YSKLRIWEFV EYNKMIYLDG DIQVFDNIDH LFDLPNGQFY AVMDCFCEKT WSHSPQYKIG YCQQCPDKVT WPEAKLGPKP PLYFNAGMFV YEPNLSTYHN 201: LLETVKIVPP TLFAEQDFLN MYFKDIYKPI PPVYNLVLAM LWRHPENIEL DQVKVVHYCA AGAKPWRFTG EEENMDREDI KMLVKKWWDI YNDESLDYKN 301: VVIGDSHKKQ QTLQQFIEAL SEAGALQYVK APSAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)