AT4G24000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cellulose synthase like G2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to cellulose synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cellulose synthase like G2 (CSLG2); FUNCTIONS IN: cellulose synthase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups, transferase activity; INVOLVED IN: cellulose biosynthetic process, polysaccharide biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cellulose synthase (InterPro:IPR005150); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cellulose synthase like G1 (TAIR:AT4G24010.1); Has 2950 Blast hits to 2333 proteins in 442 species: Archae - 3; Bacteria - 792; Metazoa - 2; Fungi - 20; Plants - 2101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 32 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12462142..12465471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82124.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 722 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPQRKHSTA LHTCHPCRRT IPYRIYAVFH TCGIIALMYH HVHSIVNANN TLITCLLLLS DIVLAFMWAT TTSLRLNPIH RTEYPEKYAA KPEDFPKLDV 101: FICTADPYKE PPMMVVNTAL SVMAYEYPSH KISVYVSDDG GSSLTLFALM EAAKFSKHWL PFCKNNNVQD RSPEVYFSSK SHSSSDEAEN LKMMYEDMKS 201: RVEHVVESGK VETAFIACDQ FSCVFDLWTD KFTRHDHPTI IMVLQHNETE MMPNLIYVSR EKSKVSPHHF KAGALNTLLR VSAVMTNSPI ILTLDCDMYS 301: NNPTTPLHAL CYLSDPKINF DLGFVQFPQK FQGVNKNDIY ASELKRPFDI NTVGFDGLMG PVHMGTGCFF NRRAFYGPPT TLILPEIETF GPNRIADKPI 401: KAQDILALAH DVAGCNYECN TNWGSKIGFR YGSLVEDYFT GFMLHCEGWR SIFCSPTKAA FYGDSPKCLT DVIGQQIRWS VGLLEVAFSR YNPLTYGIKP 501: LSLLMSLGYC HYAFWPFWCI PLVVYGILPQ VALIHGVSVF PKASDPWFWL YIILFLGGYA QDLSDFLLEG GTYRKWWNDQ RMWMVRGLSS FFFGFTEFTL 601: KTLNLSTQGY NVTSKSNDDN EQMKRYEQEI FDFGPSSSMF LPITTVAIMN LLAFMRGLYG IFTWGEGPVL ELMLASFAVV NCLPIYEAMV LRIDDGKLPK 701: RICFLAGLLS FVLTGSGYFF LK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)