AT1G52890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC domain containing protein 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a NAC transcription factor whose expression is induced by drought, high salt, and abscisic acid. This gene binds to ERD1 promoter in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAC domain containing protein 19 (NAC019); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAC domain containing protein 3 (TAIR:AT3G15500.1); Has 3041 Blast hits to 3033 proteins in 75 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 3041; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19697292..19698444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35816.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGIQETDPLT QLSLPPGFRF YPTDEELMVQ YLCRKAAGYD FSLQLIAEID LYKFDPWVLP NKALFGEKEW YFFSPRDRKY PNGSRPNRVA GSGYWKATGT 101: DKIISTEGQR VGIKKALVFY IGKAPKGTKT NWIMHEYRLI EPSRRNGSTK LDDWVLCRIY KKQSSAQKQV YDNGIANARE FSNNGTSSTT SSSSHFEDVL 201: DSFHQEIDNR NFQFSNPNRI SSLRPDLTEQ KTGFHGLADT SNFDWASFAG NVEHNNSVPE LGMSHVVPNL EYNCGYLKTE EEVESSHGFN NSGELAQKGY 301: GVDSFGYSGQ VGGFGFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)