AT2G31880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative leucine rich repeat transmembrane protein that is expressed in response to Pseudomonas syringae. Expression of SRRLK may be required for silencing via lsiRNAs. Regulates cell death and innate immunity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SUPPRESSOR OF BIR1 1 (SOBIR1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, positive regulation of defense response, negative regulation of floral organ abscission, positive regulation of cell death; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT5G63930.1); Has 176453 Blast hits to 132218 proteins in 4789 species: Archae - 165; Bacteria - 16198; Metazoa - 50399; Fungi - 11231; Plants - 77353; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 20682 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13554920..13556845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71115.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 641 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVPTGSANL FLRPLILAVL SFLLLSSFVS SVEWLDIDSS DLKALQVIET ELGVNSQRSS ASDVNPCGRR GVFCERRHSA TTGEYVLRVT RLVYRSRSLT 101: GTISPVIGML SELKELTLSN NQLVNAVPVD ILSCKQLEVL DLRKNRFSGQ IPGNFSSLSR LRILDLSSNK LSGNLNFLKN LRNLENLSVA NNLFSGKIPE 201: QIVSFHNLRF FDFSGNRYLE GPAPVMSSIK LQTSPHQTRH ILAETPTSSP TNKPNNSTTS KAPKGAPKPG KLKKKKKKSK KKKVAAWILG FVVGAIGGTI 301: SGFVFSVLFK LIIQAIRGSE KPPGPSIFSP LIKKAEDLAF LENEEALASL EIIGRGGCGE VFKAELPGSN GKIIAVKKVI QPPKDADELT DEDSKFLNKK 401: MRQIRSEINT VGHIRHRNLL PLLAHVSRPE CHYLVYEYME KGSLQDILTD VQAGNQELMW PARHKIALGI AAGLEYLHMD HNPRIIHRDL KPANVLLDDD 501: MEARISDFGL AKAMPDAVTH ITTSHVAGTV GYIAPEFYQT HKFTDKCDIY SFGVILGILV IGKLPSDEFF QHTDEMSLIK WMRNIITSEN PSLAIDPKLM 601: DQGFDEQMLL VLKIACYCTL DDPKQRPNSK DVRTMLSQIK H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)