AT5G63710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein (TAIR:AT5G10290.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25499475..25502598 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68437.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 614 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAHSGNGESF HDPLRGFIQR NCFRWNNQKL ILQCFMALAF VGITSSTTQP DIEGGALLQL RDSLNDSSNR LKWTRDFVSP CYSWSYVTCR GQSVVALNLA 101: SSGFTGTLSP AITKLKFLVT LELQNNSLSG ALPDSLGNMV NLQTLNLSVN SFSGSIPASW SQLSNLKHLD LSSNNLTGSI PTQFFSIPTF DFSGTQLICG 201: KSLNQPCSSS SRLPVTSSKK KLRDITLTAS CVASIILFLG AMVMYHHHRV RRTKYDIFFD VAGEDDRKIS FGQLKRFSLR EIQLATDSFN ESNLIGQGGF 301: GKVYRGLLPD KTKVAVKRLA DYFSPGGEAA FQREIQLISV AVHKNLLRLI GFCTTSSERI LVYPYMENLS VAYRLRDLKA GEEGLDWPTR KRVAFGSAHG 401: LEYLHEHCNP KIIHRDLKAA NILLDNNFEP VLGDFGLAKL VDTSLTHVTT QVRGTMGHIA PEYLCTGKSS EKTDVFGYGI TLLELVTGQR AIDFSRLEEE 501: ENILLLDHIK KLLREQRLRD IVDSNLTTYD SKEVETIVQV ALLCTQGSPE DRPAMSEVVK MLQGTGGLAE KWTEWEQLEE VRNKEALLLP TLPATWDEEE 601: TTVDQESIRL STAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)