AT1G63430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein (TAIR:AT5G41180.1); Has 82848 Blast hits to 42885 proteins in 1486 species: Archae - 53; Bacteria - 3071; Metazoa - 10740; Fungi - 681; Plants - 62873; Viruses - 91; Other Eukaryotes - 5339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23522896..23526451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73913.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 664 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSKYFCSLA LVLGLFFVSC DGFASNEVQA LRRFKEAIYE DPLLVMSNWN DPNSDPCDWT GIYCSPSKDH VIKINISASS IKGFLAPELG QITYLQELIL 101: HGNILIGTIP KEIGNLKNLK ILDLGNNHLM GPIPAEIGSL SGIMIINLQS NGLTGKLPAE LGNLKYLREL HIDRNRLQGS LLVAGASGYQ SKVYSSNSSA 201: NIAGLCKSLK VADFSYNFFV GNIPKCLENL PRTSFQGNCM QNKDLKHRSS SQCANAQLVK THGSPSAAPK HQSAQMVAKH HRASKPKWLL ALEIVTGSMV 301: GLLLLVALFS AVHRWNNRST LIIPWKKSSS EKEKFTVYVD SEMLKDVSRL TRQELEVACE DFSNIIGLSA DSQIYKGTLK GGSEIAVISL CVKEEDWTGY 401: LELYFQREVA DLARLNHENT AKLLGYCKEI SPFTRMLVFE YASNGTLYEH LHYGEAALVS WARRMKIVIG IARGLKYLHM ELDPPFTISE LSSNAIYLTE 501: DFTPKLVDFE CWKTILARSE KNLRNISSQG SICVLPNGME SRYLDVSGNI YAFGILLLEI VSGRPPYCKD KGFLIEWAKE FLEAPEAMSG LVDPELKHFN 601: QEDLETVCEV ASQCLNRDPT NNNNNHNKPS VQELCETLES RISLSISAEL RSSSLAWAEL ALDS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)