AT2G01910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Microtubule associated protein (MAP65/ASE1) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Binds microtubules. Induces a crisscross mesh of microtubules, not bundles. Not involved in microtubule polymerization nor nucleation. Localizes to mitochondria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATMAP65-6; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Microtubule-associated protein, MAP65/ASE1-type (InterPro:IPR007145); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: microtubule-associated protein 65-7 (TAIR:AT1G14690.2); Has 5922 Blast hits to 4912 proteins in 547 species: Archae - 118; Bacteria - 527; Metazoa - 2917; Fungi - 542; Plants - 628; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 1179 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:417191..420182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69410.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 608 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLEIGSPNAL FFRTNTTCNN LLRELQKIWV EIGETETEKD RMLMELEREC LQIYQRKVDE AANSKAKLHQ SVASIEAEVA SLMAALGVLN INSPIKLDKG 101: SKSLKEKLAA VTPLVEELRI QKEERMKQFS DIKAQIEKIS GEISGYSDHL NKAMNISLTL EEQDLTLRNL NEYQTHLRTL QKEKSDRLNK VLGYVNEVHA 201: LCGVLGVDFS QTVSAVHPSL HRTDQEQSTN ISDSTLEGLE HMIQKLKTER KSRFQKLKDV VASLFELWNL MDTPQEDRTK FGKVTYVVRS SEANITEPGI 301: LSTETIEQVS TEVDSLSKLK ASRMKELVMK RRSELEDLCR LTHIQPDTST SAEKSTALID SGLVDPSELL ANIEMQINKI KDEAQSRKDI MDRIDRWLSA 401: CEEENWLEEY NLDENRYSAG RGGHVNLKRA ERARVTINKI PGMVDTLIKK TLVWEEDMQK SFLYDGVRLV NILEDYKLTR KQQEEEKKRY RDQKKRQDLL 501: LTQRESIYGS KPSPRRSSSF RKPNGFNISN GNGSVPPTPR RGSVGTTTPD VLLTPRSYSG HHRQNGYFKE VRRLSTTPLN YVAMQKEDTV STTYTSIYSS 601: EPDSPLQG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)