AT4G31250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.876 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: shoot apex, embryo, leaf whorl, sepal, flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT5G35390.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15179201..15181751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75239.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 676 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTRDDKFPIV YSLLLIVLLF VSPIYGDGDA DALLKFKSSL VNASSLGGWD SGEPPCSGDK GSDSKWKGVM CSNGSVFALR LENMSLSGEL DVQALGSIRG 101: LKSISFMRNH FEGKIPRGID GLVSLAHLYL AHNQFTGEID GDLFSGMKAL LKVHLEGNRF SGEIPESLGK LPKLTELNLE DNMFTGKIPA FKQKNLVTVN 201: VANNQLEGRI PLTLGLMNIT FFSGNKGLCG APLLPCRYTR PPFFTVFLLA LTILAVVVLI TVFLSVCILS RRQGKGQDQI QNHGVGHFHG QVYGQPEQQQ 301: HSEKSSQDSK VYRKLANETV QRDSTATSGA ISVGGLSPDE DKRGDQRKLH FVRNDQERFT LQDMLRASAE VLGSGGFGSS YKAALSSGRA VVVKRFRFMS 401: NIGREEFYDH MKKIGRLSHP NLLPLIAFYY RKEEKLLVTN YISNGSLANL LHANRTPGQV VLDWPIRLKI VRGVTRGLAY LYRVFPDLNL PHGHLKSSNV 501: LLDPNFEPLL TDYALVPVVN RDQSQQFMVA YKAPEFTQQD RTSRRSDVWS LGILILEILT GKFPANYLRQ GKGADDELAA WVESVARTEW TADVFDKEMK 601: AGKEHEAQML KLLKIGLRCC DWDIEKRIEL HEAVDRIEEV DRDAGGGQES VRSSYVTASD GDHRSSRAMT EEFSLM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)