AT1G14700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.731 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 3 (PAP3); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 8 (TAIR:AT2G01890.1); Has 1143 Blast hits to 1133 proteins in 280 species: Archae - 0; Bacteria - 267; Metazoa - 336; Fungi - 8; Plants - 196; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 336 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5058680..5060988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42054.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 366 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTYIYRDTKI TTKSTIPFLI FFLFCFSNLS MATLKHKPVN LVFYVYNLII IFSSHSSTAE LRRLLQPSKT DGTVSFLVIG DWGRRGSYNQ SQVALQMGEI 101: GEKLDIDFVI STGDNFYDNG LTSLHDPLFQ DSFTNIYTAP SLQKPWYSVL GNHDYRGDVR AQLSPMLRAL DNRWVCMRSF IVNAEIVDLF FVDTTPFVDK 201: YFIQPNKHVY DWSGVLPRQT YLNNLLKELD VALRESVAKW KIVIGHHTIK SAGHHGNTIE LEKHLLPILQ ANEVDLYVNG HDHCLEHISS VDSNIQFMTS 301: GGGSKAWKGG DVNYVEPEEM RFYYDGQGFM SVHVSEAELR VVFYDVFGHV LHHWKKTYKE ALYFAS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)