AT3G50440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein shown to have methyl jasmonate esterase activity in vitro. This protein does not act on methyl IAA, MeSA, MeGA4, or MEGA9 in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 10 (MES10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 1 (TAIR:AT2G23620.1); Has 1602 Blast hits to 1600 proteins in 360 species: Archae - 4; Bacteria - 838; Metazoa - 1; Fungi - 25; Plants - 612; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 122 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18717392..18718435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32972.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 288 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCIYITNEWT KDNMTYQKQY QMQTHHMQQQ QLHHFVFVHG SCHGAWCWFK LAAKLKLDGH RVTAIDLGGS GVDTRQLHEV RLVSAYLEPL MSFMESLPEN 101: EKVVLVGHSY GGIGTSLAME RFPTKVSVGI FLSAYMPHHD SPPAVLIQEY FTRLPEGFAM DCEFTFEEGL EHPPSSVLFG TSFLKEKAYS NCQLEDLELA 201: MALMKPSWLY TKEMGGEDLI TKERYGSGKR VFIVCEGDNV VPEEIQKWMI SNYEPHEVKR IEEAGHMAML TKPHELSQLL QEIAAKYN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)