AT1G47960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cell wall / vacuolar inhibitor of fructosidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Plant cell wall (CWI) and vacuolar invertases (VI) play important roles in carbohydrate metabolism, stress responses and sugar signaling. This protein may inhibit their activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cell wall / vacuolar inhibitor of fructosidase 1 (C/VIF1); FUNCTIONS IN: enzyme inhibitor activity, pectinesterase inhibitor activity, pectinesterase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cell wall; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase inhibitor (InterPro:IPR006501); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein (TAIR:AT3G17140.1); Has 169 Blast hits to 167 proteins in 23 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 169; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17681954..17683516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22327.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 205 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKMMKVMMLI VMMMMVMVMV SEGSIIEPTC KETPDFNLCV SLLNSDPRGS SADTSGLALI LIDKIKGLAT KTLNEINGLY KKRPELKRAL DECSRRYKTI 101: LNADVPEAIE AISKGVPKFG EDGVIDAGVE ASVCQGGFNG SSPLTSLTKS MQKISNVTRA IFYSNSIVKE EACGSSWPSL ALNIDSKACV VSLQNIQFNR 201: GRTCW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)