AT1G25230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity, protein serine/threonine phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 3 (TAIR:AT1G14700.1); Has 1153 Blast hits to 1147 proteins in 286 species: Archae - 1; Bacteria - 297; Metazoa - 336; Fungi - 8; Plants - 186; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 325 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8840474..8842298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38243.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSKFDIGSL SIVMTLLICF LLLSLAPKLE AELATVQHAP NPDGSISFLV IGDWGRHGLY NQSQVALQMG RIGEEMDINF VVSTGDNIYD NGMKSIDDPA 101: FQLSFSNIYT SPSLQKPWYL VLGNHDYRGD VEAQLSPILR SMDSRWICMR SFIVDAEIAE LFFVDTTPFV DAYFLSPQDQ TYDWSGVSPR KSYLQTILTE 201: LEMGLRESSA KWKIVVGHHA IKSASIHGNT KELESLLLPI LEANKVDLYM NGHDHCLQHI STSQSPIQFL TSGGGSKAWR GYYNWTTPED MKFFYDGQGF 301: MSVKITRSEL SVVFYDVSGN SLHKWDTSKM LDSDFYFPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)