AT3G02880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: anchored to plasma membrane, cell wall, plasma membrane, membrane, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT5G16590.1); Has 140419 Blast hits to 103539 proteins in 3753 species: Archae - 105; Bacteria - 10616; Metazoa - 37369; Fungi - 7261; Plants - 69256; Viruses - 279; Other Eukaryotes - 15533 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:634819..636982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67756.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 627 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKYKRKLSLS VVFLFVFYLA AVTSDLESDR RALLAVRNSV RGRPLLWNMS ASSPCNWHGV HCDAGRVTAL RLPGSGLFGS LPIGGIGNLT QLKTLSLRFN 101: SLSGPIPSDF SNLVLLRYLY LQGNAFSGEI PSLLFTLPSI IRINLGENKF SGRIPDNVNS ATRLVTLYLE RNQLSGPIPE ITLPLQQFNV SSNQLNGSIP 201: SSLSSWPRTA FEGNTLCGKP LDTCEAESPN GGDAGGPNTP PEKKDSDKLS AGAIVGIVIG CVVGLLLLLL ILFCLCRKRK KEENVPSRNV EAPVAAATSS 301: AAIPKETVVV VPPAKATGSE SGAVNKDLTF FVKSFGEFDL DGLLKASAEV LGKGTVGSSY KASFEHGLVV AVKRLRDVVV PEKEFRERLH VLGSMSHANL 401: VTLIAYYFSR DEKLLVFEYM SKGSLSAILH GNKGNGRTPL NWETRAGIAL GAARAISYLH SRDGTTSHGN IKSSNILLSD SYEAKVSDYG LAPIISSTSA 501: PNRIDGYRAP EITDARKISQ KADVYSFGVL ILELLTGKSP THQQLNEEGV DLPRWVQSVT EQQTPSDVLD PELTRYQPEG NENIIRLLKI GMSCTAQFPD 601: SRPSMAEVTR LIEEVSHSSG SPNPVSD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)