AT1G19430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT5G64030.1); Has 8058 Blast hits to 6201 proteins in 616 species: Archae - 19; Bacteria - 712; Metazoa - 2431; Fungi - 867; Plants - 1254; Viruses - 124; Other Eukaryotes - 2651 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6724669..6727533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82665.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 724 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMERKREMGI AYFARRIKQP RGIWVKMTFI VVLGLCFVFF WSFLSSSAST FNVQRESFDD IAEPVSSRTK SAHEVSESSK LHERGKVESG SKSKEGKKVG 101: GSSVHKHETK KKKEHAVSHP HKKKDVPKPV VEEVVVKEDQ EHEEAESDDS DQSNKEDGEE GTESDGNEGE SDGNGDGSVD DSSASVDEEV EEKNEEVTVN 201: EISKKRKRKG PVFDPKAEYS WRLCNTRSKH NYMPCIDNDG LIGRLQSYRH RERSCPKKPV MCLVPLPHDG YDPPVSWPES KSKILYKNVA HPKLAAYIKK 301: HNWVNETGEY LSFPQNQTTF NGNVLQYLEF IQEMVPDIEW GKNVRIVLDI GCSDSSFVAA LLDKDVLTVS LGLKDDLVDL AQVALERGFP TFVSSLASRR 401: LPFPSGVFDT IHCAACGVHW HSHGGKLLLE MNRILRPNGY FILSSNNDKI EDDEAMTALT ASICWNILAH KTEEASEMGV RIYQKPESND IYELRRKKNP 501: PLCEDNENPD AAWYVPMKTC IYEIPSAIEQ HGAEWPEEWP KRLETYPEWL TSKEKAMEDT NHWNAMVNKS YLTGLGIDWL HIRNVMDMTA IYGGFGASLV 601: KQNVWVMNVV PVHSPDTLPF IYERGLLGIY HDWCEPFGTY PRSYDLLHAD HLFSRLKNRC KQPASIVVEM DRLTRPGGWV VVRDKVEILE PLEEILRSLH 701: WEIRMTYAQD KEGMLCAQKT LWRP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)