AT2G38650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 7 (GAUT7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 4 (TAIR:AT5G47780.1); Has 1759 Blast hits to 1736 proteins in 364 species: Archae - 0; Bacteria - 688; Metazoa - 154; Fungi - 63; Plants - 827; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 25 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16161856..16165523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69752.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 619 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGGGGGGGG GGGGKRRWKV LVIGVLVLVI LSMLVPLAFL LGLHNGFHSP GFVTVQPASS FESFTRINAT KHTQRDVSER VDEVLQKINP VLPKKSDINV 101: GSRDVNATSG TDSKKRGLPV SPTVVANPSP ANKTKSEASY TGVQRKIVSG DETWRTCEVK YGSYCLWREE NKEPMKDAKV KQMKDQLFVA RAYYPSIAKM 201: PSQSKLTRDM KQNIQEFERI LSESSQDADL PPQVDKKLQK MEAVIAKAKS FPVDCNNVDK KLRQILDLTE DEASFHMKQS VFLYQLAVQT MPKSLHCLSM 301: RLTVEHFKSD SLEDPISEKF SDPSLLHFVI ISDNILASSV VINSTVVHAR DSKNFVFHVL TDEQNYFAMK QWFIRNPCKQ STVQVLNIEK LELDDSDMKL 401: SLSAEFRVSF PSGDLLASQQ NRTHYLSLFS QSHYLLPKLF DKLEKVVILD DDVVVQRDLS PLWDLDMEGK VNGAVKSCTV RLGQLRSLKR GNFDTNACLW 501: MSGLNVVDLA RWRALGVSET YQKYYKEMSS GDESSEAIAL QASLLTFQDQ VYALDDKWAL SGLGYDYYIN AQAIKNAAIL HYNGNMKPWL ELGIPNYKNY 601: WRRHLSREDR FLSDCNVNP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)