AT3G02350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 9 (GAUT9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein (TAIR:AT3G25140.1); Has 1426 Blast hits to 1422 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 444; Metazoa - 141; Fungi - 7; Plants - 818; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 16 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:479248..481178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64163.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 561 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVAFRGGRG GVGSGQSTGL RSFFSYRIFI SALFSFLFLA TFSVVLNSSR HQPHQDHTLP SMGNAYMQRT FLALQSDPLK TRLDLIHKQA IDHLTLVNAY 101: AAYARKLKLD ASKQLKLFED LAINFSDLQS KPGLKSAVSD NGNALEEDSF RQLEKEVKDK VKTARMMIVE SKESYDTQLK IQKLKDTIFA VQEQLTKAKK 201: NGAVASLISA KSVPKSLHCL AMRLVGERIS NPEKYKDAPP DPAAEDPTLY HYAIFSDNVI AVSVVVRSVV MNAEEPWKHV FHVVTDRMNL AAMKVWFKMR 301: PLDRGAHVEI KSVEDFKFLN SSYAPVLRQL ESAKLQKFYF ENQAENATKD SHNLKFKNPK YLSMLNHLRF YLPEMYPKLN KILFLDDDVV VQKDVTGLWK 401: INLDGKVNGA VETCFGSFHR YGQYLNFSHP LIKENFNPSA CAWAFGMNIF DLNAWRREKC TDQYHYWQNL NEDRTLWKLG TLPPGLITFY SKTKSLDKSW 501: HVLGLGYNPG VSMDEIRNAG VIHYNGNMKP WLDIAMNQYK SLWTKYVDNE MEFVQMCNFG L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)