AT3G61130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 1 (GAUT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 3 (TAIR:AT4G38270.2); Has 1521 Blast hits to 1503 proteins in 273 species: Archae - 4; Bacteria - 491; Metazoa - 148; Fungi - 2; Plants - 840; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 36 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22622399..22625514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77377.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 673 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALKRGLSGV NRIRGSGGGS RSVLVLLIFF CVFAPLCFFV GRGVYIDSSN DYSIVSVKQN LDWRERLAMQ SVRSLFSKEI LDVIATSTAD LGPLSLDSFK 101: KNNLSASWRG TGVDPSFRHS ENPATPDVKS NNLNEKRDSI SKDSIHQKVE TPTKIHRRQL REKRREMRAN ELVQHNDDTI LKLENAAIER SKSVDSAVLG 201: KYSIWRRENE NDNSDSNIRL MRDQVIMARV YSGIAKLKNK NDLLQELQAR LKDSQRVLGE ATSDADLPRS AHEKLRAMGQ VLAKAKMQLY DCKLVTGKLR 301: AMLQTADEQV RSLKKQSTFL AQLAAKTIPN PIHCLSMRLT IDYYLLSPEK RKFPRSENLE NPNLYHYALF SDNVLAASVV VNSTIMNAKD PSKHVFHLVT 401: DKLNFGAMNM WFLLNPPGKA TIHVENVDEF KWLNSSYCPV LRQLESAAMR EYYFKADHPT SGSSNLKYRN PKYLSMLNHL RFYLPEVYPK LNKILFLDDD 501: IIVQKDLTPL WEVNLNGKVN GAVETCGESF HRFDKYLNFS NPHIARNFNP NACGWAYGMN MFDLKEWKKR DITGIYHKWQ NMNENRTLWK LGTLPPGLIT 601: FYGLTHPLNK AWHVLGLGYN PSIDKKDIEN AAVVHYNGNM KPWLELAMSK YRPYWTKYIK FDHPYLRRCN LHE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)