AT2G29560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytosolic enolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative phosphoenolpyruvate enolase that is localized both to the nucleus and the cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytosolic enolase (ENOC); FUNCTIONS IN: phosphopyruvate hydratase activity, magnesium ion binding; INVOLVED IN: glycolysis; LOCATED IN: nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Enolase (InterPro:IPR000941), Enolase, C-terminal (InterPro:IPR020810), Enolase, conserved site (InterPro:IPR020809), Enolase, N-terminal (InterPro:IPR020811); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Enolase (TAIR:AT2G36530.1); Has 13178 Blast hits to 13156 proteins in 3650 species: Archae - 272; Bacteria - 5726; Metazoa - 2098; Fungi - 281; Plants - 257; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4544 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12646635..12649694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51602.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 475 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVQEYLDKH MLSRKIEDAV NAAVRAKTSD PVLFIANHLK KAVSSVITKV KARQILDSRG IPTVEVDLHT NKGVFRASVP SGDSSGTYEA IELRDGDKGM 101: YLGNSVAKAV KNINEKISEA LIGMDPKLQG QIDQAMIDLD KTEKKSELGA NAILAVSIAA CKAGAAEKEV PLCKHLSDLS GRANMVLPVP AFTVLSGGKH 201: ASNTFAIQEI MILPIGASRF EEALQWGSET YHHLKAVISE KNGGLGCNVG EDGGLAPDIS SLKEGLELVK EAINRTGYND KIKIAIDIAA TNFCLGTKYD 301: LDIKSPNKSG QNFKSAEDMI DMYKEICNDY PIVSIEDPFD KEDWEHTKYF SSLGICQVVG DDLLMSNSKR VERAIQESSC NALLLKVNQI GTVTEAIEVV 401: KMARDAQWGV VTSHRCGETE DSFISDLSVG LATGVIKAGA PCRGERTMKY NQLLRIEEEL GDQAVYAGED WKLSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)