AT2G01820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: pollen development; LOCATED IN: plasma membrane, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat, typical subtype (InterPro:IPR003591), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transmembrane kinase 1 (TAIR:AT1G66150.1); Has 179395 Blast hits to 141441 proteins in 4928 species: Archae - 173; Bacteria - 19044; Metazoa - 57542; Fungi - 11766; Plants - 68071; Viruses - 436; Other Eukaryotes - 22363 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:357664..360681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 101965.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 943 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNSHLGTLC FIISLLGLAN FSLSQTGLDD STMQSLKSSL NLTSDVDWSN PNPCKWQSVQ CDGSNRVTKI QLKQKGIRGT LPTNLQSLSE LVILELFLNR 101: ISGPIPDLSG LSRLQTLNLH DNLFTSVPKN LFSGMSSLQE MYLENNPFDP WVIPDTVKEA TSLQNLTLSN CSIIGKIPDF FGSQSLPSLT NLKLSQNGLE 201: GELPMSFAGT SIQSLFLNGQ KLNGSISVLG NMTSLVEVSL QGNQFSGPIP DLSGLVSLRV FNVRENQLTG VVPQSLVSLS SLTTVNLTNN YLQGPTPLFG 301: KSVGVDIVNN MNSFCTNVAG EACDPRVDTL VSVAESFGYP VKLAESWKGN NPCVNWVGIT CSGGNITVVN MRKQDLSGTI SPSLAKLTSL ETINLADNKL 401: SGHIPDELTT LSKLRLLDVS NNDFYGIPPK FRDTVTLVTE GNANMGKNGP NKTSDAPGAS PGSKPSGGSD GSETSKKSSN VKIIVPVVGG VVGALCLVGL 501: GVCLYAKKRK RPARVQSPSS NMVIHPHHSG DNDDIKLTVA ASSLNSGGGS DSYSHSGSAA SDIHVVEAGN LVISIQVLRN VTNNFSEENI LGRGGFGTVY 601: KGELHDGTKI AVKRMESSVV SDKGLTEFKS EITVLTKMRH RHLVALLGYC LDGNERLLVY EYMPQGTLSQ HLFHWKEEGR KPLDWTRRLA IALDVARGVE 701: YLHTLAHQSF IHRDLKPSNI LLGDDMRAKV SDFGLVRLAP DGKYSIETRV AGTFGYLAPE YAVTGRVTTK VDIFSLGVIL MELITGRKAL DETQPEDSVH 801: LVTWFRRVAA SKDENAFKNA IDPNISLDDD TVASIEKVWE LAGHCCAREP YQRPDMAHIV NVLSSLTVQW KPTETDPDDV YGIDYDMPLP QVLKKWQAFE 901: GLSQTADDSG SSSSAYGSKD NTQTSIPTRP SGFADSFTSV DGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)