AT5G65710.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.893 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : HAESA-like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HAESA-like 2 (HSL2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HAESA-like 1 (TAIR:AT1G28440.1); Has 209953 Blast hits to 136246 proteins in 4591 species: Archae - 161; Bacteria - 21175; Metazoa - 62961; Fungi - 10773; Plants - 89081; Viruses - 373; Other Eukaryotes - 25429 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26292372..26295440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 110716.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 993 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLTNTNLFFF LSLLLLSCFL QVSSNGDAEI LSRVKKTRLF DPDGNLQDWV ITGDNRSPCN WTGITCHIRK GSSLAVTTID LSGYNISGGF PYGFCRIRTL 101: INITLSQNNL NGTIDSAPLS LCSKLQNLIL NQNNFSGKLP EFSPEFRKLR VLELESNLFT GEIPQSYGRL TALQVLNLNG NPLSGIVPAF LGYLTELTRL 201: DLAYISFDPS PIPSTLGNLS NLTDLRLTHS NLVGEIPDSI MNLVLLENLD LAMNSLTGEI PESIGRLESV YQIELYDNRL SGKLPESIGN LTELRNFDVS 301: QNNLTGELPE KIAALQLISF NLNDNFFTGG LPDVVALNPN LVEFKIFNNS FTGTLPRNLG KFSEISEFDV STNRFSGELP PYLCYRRKLQ KIITFSNQLS 401: GEIPESYGDC HSLNYIRMAD NKLSGEVPAR FWELPLTRLE LANNNQLQGS IPPSISKARH LSQLEISANN FSGVIPVKLC DLRDLRVIDL SRNSFLGSIP 501: SCINKLKNLE RVEMQENMLD GEIPSSVSSC TELTELNLSN NRLRGGIPPE LGDLPVLNYL DLSNNQLTGE IPAELLRLKL NQFNVSDNKL YGKIPSGFQQ 601: DIFRPSFLGN PNLCAPNLDP IRPCRSKRET RYILPISILC IVALTGALVW LFIKTKPLFK RKPKRTNKIT IFQRVGFTEE DIYPQLTEDN IIGSGGSGLV 701: YRVKLKSGQT LAVKKLWGET GQKTESESVF RSEVETLGRV RHGNIVKLLM CCNGEEFRFL VYEFMENGSL GDVLHSEKEH RAVSPLDWTT RFSIAVGAAQ 801: GLSYLHHDSV PPIVHRDVKS NNILLDHEMK PRVADFGLAK PLKREDNDGV SDVSMSCVAG SYGYIAPEYG YTSKVNEKSD VYSFGVVLLE LITGKRPNDS 901: SFGENKDIVK FAMEAALCYP SPSAEDGAMN QDSLGNYRDL SKLVDPKMKL STREYEEIEK VLDVALLCTS SFPINRPTMR KVVELLKEKK SLE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)