AT2G26330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Homologous to receptor protein kinases. Involved in specification of organs originating from the shoot apical meristem. Contains a cytoplasmic protein kinase catalytic domain, a transmembrane region, and an extracellular leucine-rich repeat. ER has been identified as a quantitative trait locus for transpiration efficiency by influencing epidermal and mesophyll development, stomatal density and porosity of leaves. It has been implicated in resistance to the bacterium Ralstonia solanacearum and to the necrotrophic fungus Plectosphaerella cucumerina. Together with ERL1 and ERL2, ER governs the initial decision of protodermal cells to either divide proliferatively to produce pavement cells or divide asymmetrically to generate stomatal complexes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ERECTA (ER); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ERECTA-like 2 (TAIR:AT5G07180.1); Has 231155 Blast hits to 140492 proteins in 4172 species: Archae - 144; Bacteria - 21921; Metazoa - 82313; Fungi - 10847; Plants - 87687; Viruses - 446; Other Eukaryotes - 27797 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11208367..11213895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 107340.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 976 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALFRDIVLL GFLFCLSLVA TVTSEEGATL LEIKKSFKDV NNVLYDWTTS PSSDYCVWRG VSCENVTFNV VALNLSDLNL DGEISPAIGD LKSLLSIDLR 101: GNRLSGQIPD EIGDCSSLQN LDLSFNELSG DIPFSISKLK QLEQLILKNN QLIGPIPSTL SQIPNLKILD LAQNKLSGEI PRLIYWNEVL QYLGLRGNNL 201: VGNISPDLCQ LTGLWYFDVR NNSLTGSIPE TIGNCTAFQV LDLSYNQLTG EIPFDIGFLQ VATLSLQGNQ LSGKIPSVIG LMQALAVLDL SGNLLSGSIP 301: PILGNLTFTE KLYLHSNKLT GSIPPELGNM SKLHYLELND NHLTGHIPPE LGKLTDLFDL NVANNDLEGP IPDHLSSCTN LNSLNVHGNK FSGTIPRAFQ 401: KLESMTYLNL SSNNIKGPIP VELSRIGNLD TLDLSNNKIN GIIPSSLGDL EHLLKMNLSR NHITGVVPGD FGNLRSIMEI DLSNNDISGP IPEELNQLQN 501: IILLRLENNN LTGNVGSLAN CLSLTVLNVS HNNLVGDIPK NNNFSRFSPD SFIGNPGLCG SWLNSPCHDS RRTVRVSISR AAILGIAIGG LVILLMVLIA 601: ACRPHNPPPF LDGSLDKPVT YSTPKLVILH MNMALHVYED IMRMTENLSE KYIIGHGASS TVYKCVLKNC KPVAIKRLYS HNPQSMKQFE TELEMLSSIK 701: HRNLVSLQAY SLSHLGSLLF YDYLENGSLW DLLHGPTKKK TLDWDTRLKI AYGAAQGLAY LHHDCSPRII HRDVKSSNIL LDKDLEARLT DFGIAKSLCV 801: SKSHTSTYVM GTIGYIDPEY ARTSRLTEKS DVYSYGIVLL ELLTRRKAVD DESNLHHLIM SKTGNNEVME MADPDITSTC KDLGVVKKVF QLALLCTKRQ 901: PNDRPTMHQV TRVLGSFMLS EQPPAATDTS ATLAGSCYVD EYANLKTPHS VNCSSMSASD AQLFLRFGQV ISQNSE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)