AT2G13800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.718 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : somatic embryogenesis receptor-like kinase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
somatic embryogenesis receptor-like kinase 5 (SERK5); FUNCTIONS IN: protein kinase activity, transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: somatic embryogenesis receptor-like kinase 4 (TAIR:AT2G13790.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:5753276..5757065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66985.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 601 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEHGSSRGFI WLILFLDFVS RVTGKTQVDA LIALRSSLSS GDHTNNILQS WNATHVTPCS WFHVTCNTEN SVTRLDLGSA NLSGELVPQL AQLPNLQYLE 101: LFNNNITGEI PEELGDLMEL VSLDLFANNI SGPIPSSLGK LGKLRFLRLY NNSLSGEIPR SLTALPLDVL DISNNRLSGD IPVNGSFSQF TSMSFANNKL 201: RPRPASPSPS PSGTSAAIVV GVAAGAALLF ALAWWLRRKL QGHFLDVPAE EDPEVYLGQF KRFSLRELLV ATEKFSKRNV LGKGRFGILY KGRLADDTLV 301: AVKRLNEERT KGGELQFQTE VEMISMAVHR NLLRLRGFCM TPTERLLVYP YMANGSVASC LRERPEGNPA LDWPKRKHIA LGSARGLAYL HDHCDQKIIH 401: LDVKAANILL DEEFEAVVGD FGLAKLMNYN DSHVTTAVRG TIGHIAPEYL STGKSSEKTD VFGYGVMLLE LITGQKAFDL ARLANDDDIM LLDWVKEVLK 501: EKKLESLVDA ELEGKYVETE VEQLIQMALL CTQSSAMERP KMSEVVRMLE GDGLAERWEE WQKEEMPIHD FNYQAYPHAG TDWLIPYSNS LIENDYPSGP 601: R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)