AT3G25560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NSP-interacting kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NSP-interacting kinase 2 (NIK2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NSP-interacting kinase 1 (TAIR:AT5G16000.1); Has 173817 Blast hits to 117543 proteins in 4488 species: Archae - 109; Bacteria - 15009; Metazoa - 43670; Fungi - 8369; Plants - 87261; Viruses - 427; Other Eukaryotes - 18972 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9279682..9282560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70609.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 635 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLQGRREAKK SYALFSSTFF FFFICFLSSS SAELTDKGVN FEVVALIGIK SSLTDPHGVL MNWDDTAVDP CSWNMITCSD GFVIRLEAPS QNLSGTLSSS 101: IGNLTNLQTV LLQNNYITGN IPHEIGKLMK LKTLDLSTNN FTGQIPFTLS YSKNLQYLRV NNNSLTGTIP SSLANMTQLT FLDLSYNNLS GPVPRSLAKT 201: FNVMGNSQIC PTGTEKDCNG TQPKPMSITL NSSQNKSSDG GTKNRKIAVV FGVSLTCVCL LIIGFGFLLW WRRRHNKQVL FFDINEQNKE EMCLGNLRRF 301: NFKELQSATS NFSSKNLVGK GGFGNVYKGC LHDGSIIAVK RLKDINNGGG EVQFQTELEM ISLAVHRNLL RLYGFCTTSS ERLLVYPYMS NGSVASRLKA 401: KPVLDWGTRK RIALGAGRGL LYLHEQCDPK IIHRDVKAAN ILLDDYFEAV VGDFGLAKLL DHEESHVTTA VRGTVGHIAP EYLSTGQSSE KTDVFGFGIL 501: LLELITGLRA LEFGKAANQR GAILDWVKKL QQEKKLEQIV DKDLKSNYDR IEVEEMVQVA LLCTQYLPIH RPKMSEVVRM LEGDGLVEKW EASSQRAETN 601: RSYSKPNEFS SSERYSDLTD DSSVLVQAME LSGPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)