AT4G30520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT2G23950.1); Has 174451 Blast hits to 119898 proteins in 4449 species: Archae - 119; Bacteria - 15134; Metazoa - 46216; Fungi - 8564; Plants - 84893; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 19100 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14908193..14911040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71197.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 648 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVVVTKKTMK IQIHLLYSFL FLCFSTLTLS SEPRNPEVEA LISIRNNLHD PHGALNNWDE FSVDPCSWAM ITCSPDNLVI GLGAPSQSLS GGLSESIGNL 101: TNLRQVSLQN NNISGKIPPE LGFLPKLQTL DLSNNRFSGD IPVSIDQLSS LQYLRLNNNS LSGPFPASLS QIPHLSFLDL SYNNLSGPVP KFPARTFNVA 201: GNPLICRSNP PEICSGSINA SPLSVSLSSS SGRRSNRLAI ALSVSLGSVV ILVLALGSFC WYRKKQRRLL ILNLNDKQEE GLQGLGNLRS FTFRELHVYT 301: DGFSSKNILG AGGFGNVYRG KLGDGTMVAV KRLKDINGTS GDSQFRMELE MISLAVHKNL LRLIGYCATS GERLLVYPYM PNGSVASKLK SKPALDWNMR 401: KRIAIGAARG LLYLHEQCDP KIIHRDVKAA NILLDECFEA VVGDFGLAKL LNHADSHVTT AVRGTVGHIA PEYLSTGQSS EKTDVFGFGI LLLELITGLR 501: ALEFGKTVSQ KGAMLEWVRK LHEEMKVEEL LDRELGTNYD KIEVGEMLQV ALLCTQYLPA HRPKMSEVVL MLEGDGLAER WAASHNHSHF YHANISFKTI 601: SSLSTTSVSR LDAHCNDPTY QMFGSSAFDD DDDHQPLDSF AMELSGPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)