AT2G14510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT2G14440.1); Has 142542 Blast hits to 115596 proteins in 3812 species: Archae - 89; Bacteria - 12558; Metazoa - 42060; Fungi - 9008; Plants - 61359; Viruses - 344; Other Eukaryotes - 17124 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6171133..6175052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97640.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 868 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METRNKFMLL ACATFSIMSL VKSQNQQGFI SLDCGLPSKE SYIEPSSNLT FISDVNFIRG GKTGNIQNNS RTNFIFKPFK VLRYFPDGIR NCYSLSVKQG 101: TKYLIRTLFY YGNYDGLNTS PRFDLFLGPN IWTSVDVLIA DVGDGVVEEI VHVTRSNILD ICLVKTGTST PMISAIELRP LRYDTYTART GSLKSMAHFY 201: FTNSDEAIRY PEDVYDRVWM PYSQPEWTQI NTTRNVSGFS DGYNPPQGVI QTASIPTNGS EPLTFTWNLE SSDDETYAYL FFAEIQQLKV NETREFKILA 301: NGVDYIDYTP WKFEARTLSN PAPLKCEGGV CRVQLSKTPK STLPPLMNAI EIFSVIQFPQ SDTNTDEVIA IKKIQSTYQL SRISWQGDPC VPKQFSWMGV 401: SCNVIDISTP PRIISLDLSL SGLTGVISPS IQNLTMLREL DLSNNNLTGE VPEFLATIKP LLVIHLRGNN LRGSVPQALQ DREKNDGLKL FVDPNITRRG 501: KHQPKSWLVA IVASISCVAV TIIVLVLIFI FRRRKSSTRK VIRPSLEMKN RRFKYSEVKE MTNNFEVVLG KGGFGVVYHG FLNNEQVAVK VLSQSSTQGY 601: KEFKTEVELL LRVHHVNLVS LVGYCDEGID LALIYEFMEN GNLKEHLSGK RGGSVLNWSS RLKIAIESAL GIEYLHIGCQ PPMVHRDVKS TNILLGLRFE 701: AKLADFGLSR SFLVGSQAHV STNVAGTLGY LDPEYYLKNW LTEKSDVYSF GIVLLESITG QPVIEQSRDK SYIVEWAKSM LANGDIESIM DPNLHQDYDS 801: SSSWKALELA MLCINPSSTQ RPNMTRVAHE LNECLEIYNL TKIRSQDQNS SKSLGHTVTF ISDIPSAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)