AT2G19210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein (TAIR:AT2G19230.1); Has 166357 Blast hits to 124045 proteins in 4871 species: Archae - 115; Bacteria - 14373; Metazoa - 45388; Fungi - 9964; Plants - 77008; Viruses - 412; Other Eukaryotes - 19097 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8335639..8339307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 98438.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 881 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVHYNFLSLI IFACFFAVFV LLVRAQDQSG FVSIDCGIPE DSSYNDETTD IKYVSDAAFV ESGTIHSIDP EFQTSSLEKQ FQNVRSFPEG NRNCYDVKPP 101: QGKGFKYLIR TRFMYGNYDN LGKAPDFDLY LGFNIWDSVT IDNATTIVTK EIIHTLRSDH VHVCLVDKNR GTPFLSALEI RLLKSNTYET PYDSLILFKR 201: WDLGGLGALP VRYKDDVFDR IWIPLRFPKY TIFNASLTID SNNNEGFQPA RFVMNTATSP EDLSQDIIFS WEPKDPTWKY FVYMHFAEVV ELPSNETREF 301: KVLLNEKEIN MSSFSPRYLY TDTLFVQNPV SGPKLEFRLQ QTPRSTLPPI INAIETYRVN EFLQSPTDQQ DVDAIMRIKS KYGVKKSWLG DPCAPVKYPW 401: KDINCSYVDN ESPRIISVNL SSSGLTGEID AAFSNLTLLH ILDLSNNSLT GKIPDFLGNL HNLTELNLEG NKLSGAIPVK LLERSNKKLI LLRIDGNPDL 501: CVSASCQISD EKTKKNVYII PLVASVVGVL GLVLAIALFL LYKKRHRRGG SGGVRAGPLD TTKRYYKYSE VVKVTNNFER VLGQGGFGKV YHGVLNDDQV 601: AVKILSESSA QGYKEFRAEV ELLLRVHHKN LTALIGYCHE GKKMALIYEF MANGTLGDYL SGEKSYVLSW EERLQISLDA AQGLEYLHNG CKPPIVQRDV 701: KPANILINEK LQAKIADFGL SRSVALDGNN QDTTAVAGTI GYLDPEYHLT QKLSEKSDIY SFGVVLLEVV SGQPVIARSR TTAENIHITD RVDLMLSTGD 801: IRGIVDPKLG ERFDAGSAWK ITEVAMACAS SSSKNRPTMS HVVAELKESV SRARAGGGSG ASSVTDPAMT NFDSGMFPQA R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)